Die Basis der neurobiologischen Arbeit ist die autonome Regulationsdiagnostik, bei der zu Beginn einer Behandlung mittels eines Muskeltests festgestellt werden kann, ob das autonome Nervensystem regulationsfähig ist oder ob eine Blockade vorliegt. Darauf bauen weitere Tests auf mit der Suche nach den Ursachen der Symptome und deren Behandlung.

Die Neurobiologie nach Dr.Klinghardt umfasst folgende ganzheitlichen Methoden:

• die Autonome Regulationsdiagnostik( RD)
• die Psychokinesiologie (PK), die Mentalfeldtherapie (MFT) und
• die Augenbewegungsmethode mit Farbbrillen.

In der psychokinesiologischen Sitzung hat der Therapeut nach eingehendem Gespräch die Möglichkeit mittels des Muskeltests verdrängte Erlebnisse wieder bewusst zu machen. Durch das Wiedererinnern können sich die damit verbundenen aufgestauten Gefühle des Klienten entladen. 
In der Mentalfeldtherapie können über das Klopfen bestimmter Punkte (ähnlich den Akupunkturpunkten) Traumata gelöst werden.